Контейнер avi -- не лучшее решение для нескольких видео и аудио дорожек. Если приспичило в один файл запихивать несколько параллельных видео дорожек, то для этой цели существуют контейнеры mkv, ts, m2ts. Я не знаю, каким образом можно запихать в avi несколько видео дорожек. Видимо, каким-то совсем уж ёкэлэмэноидным способом. Просмотреть-то обе дорожки из avi легко можно плеером BE, но вот вытащить... Я нашёл один способ вытаскивания без пережатия за счёт использования бесплатного ПО. Способ не тривиальный, но освоив его один раз, ты сможешь демюксировать любую видео и аудио дорожку. И не только из avi, а из любого другого файла. Инструкцию с рисунками залил сюда:
[Для просмотра данной ссылки нужно зарегистрироваться]
Расшевелил ты меня, давненько мне никто такой интересной задачки не подкидывал.