Я понял, в чём проблема. Похоже, твои программы конвертируют в mp3 с переменным битрейтом. Вот тебе жреческое правило: если ты решил заняться конвертированием в mp3, то делай это всегда с постоянным битрейтом 320. Независимо от битрейта исходника. И никогда не изменяй частоту дискретизации! 48KHz -- хорошее значение. Сейчас время терабайтных объёмов, и экономить на качестве не нужно.
Делаешь в два прохода. Вначале разжимаешь твой файл до wav при помощи GoldWave, или Фубар. Назовём этот файл 555.wav. Далее сжимаешь этот waw в mp3 при помощи Lane.exe. Мои исследования показали, что Lame 3.93 на битрейте 320 вносит меньше искажений, чем более новые версии. Сжатие производишь при помощи bat-файла.
Вот архив с готовым bat-файлом и оригинальным релизом Lame 3.93
[Для просмотра данной ссылки нужно зарегистрироваться]